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工资税的扣除计算公式是：应纳税额=应纳税所得额×适用税率-速算扣除数。目前，个人所得税的起征点为5000元，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。
法律依据
《个人所得税法》第二条
下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
(一)工资、薪金所得；
(二)劳务报酬所得；
(三)稿酬所得；
(四)特许权使用费所得；
(五)经营所得；
(六)利息、股息、红利所得；
(七)财产租赁所得；
(八)财产转让所得；
(九)偶然所得。
工资税的计算公式是应纳税额＝（工资收入－五险一金－扣除数）×适用税率－速计扣除数。免税额为5000，使用超额累进税率的计算方法如下：纳税＝全月应纳税所得额＊税率－速计扣除数实际工资＝应发工资－四金－纳税全月应纳税所得额＝（应发工资－四金）－5000。扣除标准：个税按5000元／月的起征标准算。
《个人所得税法》第六条应纳税所得额的计算：（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。（二）非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。（三）经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。（四）财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元；四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。（五）财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额。（六）利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得以收入减除百分之二十的费用后的余额为收入额。稿酬所得的收入额减按百分之七十计算。个人将其所得对教育、扶贫、济困等公益慈善事业进行捐赠，捐赠额未超过纳税人申报的应纳税所得额百分之三十的部分，可以从其应纳税所得额中扣除；国务院规定对公益慈善事业捐赠实行全额税前扣除的，从其规定。本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。
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